Ziraat Türkiye Kupası'nda çeyrek final maçları 3-4 Şubat'ta oynanan ilk maçlar ve 10-11 Şubat'ta oynanan ikinci maçlar ile tamamlandı. Çeyrek final maçları sonunda rakiplerini eleyen Trabzonspor, Antalyaspor, Manisaspor ve Fenerbahçe yarı finale yükseldi. Yarı finalde Trabzonspor ile Antalyaspor, Manisaspor ile Fenerbahçe karşı karşıya gelecek.

Yarı final ilk maçları 24 Mart 2010 Çarşamba, rövanş karşılaşmaları ise 14 Nisan 2010 Çarşamba tarihinde oynanacak. 2009-2010 sezonu Ziraat Türkiye Kupası Şampiyonu olacak takım ise 5 Mayıs 2010 tarihindeki final maçı ile belli olacak.

Ziraat Türkiye Kupası çeyrek final maçlarında alınan sonuçlar şöyle:

Tarih-Saat	Stat	Ev Sahibi Takım	Skor	Misafir Takım	Hakemler
03.02.2010 17:00	ATATÜRK OLİMPİYAT	BÜYÜKŞEHİR BLD.SPOR	1-1	TRABZONSPOR A.Ş.	(O) ÖZGÜR YANKAYA (Y) SERKAN OK (Y) ARKIN AKGÖL (D) SERKAN ERGÜN
03.02.2010 20:00	ANTALYA ATATÜRK	ANTALYASPOR A.Ş.	2-1	GALATASARAY A.Ş.	(O) BÜLENT YILDIRIM (Y) CEM SATMAN (Y) VOLKAN NARİNÇ (D) ALİ PALABIYIK
04.02.2010 17:00	MANİSA 19 MAYIS	MANİSASPOR	4-1	DENİZLİSPOR	(O) FIRAT AYDINUS (Y) BÜLENT GÖKÇÜ (Y) ALEKS TAŞÇIOĞLU (D) TAYFUR ÖZKAN
04.02.2010 20:00	FB ŞÜKRÜ SARACOĞLU	FENERBAHÇE	3-0	BURSASPOR	(O) HÜSEYİN GÖÇEK (Y) SERKAN GENÇERLER (Y) İSMAİL ŞENCAN (D) SÜLEYMAN ABAY
10.02.2010 16:30	YENİ RİZE STADI	TRABZONSPOR A.Ş.	1-0	BÜYÜKŞEHİR BLD.SPOR	(O) HÜSEYİN GÖÇEK (Y) SERKAN GENÇERLER (Y) CEMAL BİNGÜL (D) NİHAT AKMAN
10.02.2010 20:00	ALİ SAMİ YEN	GALATASARAY A.Ş.	3-2	ANTALYASPOR A.Ş.	(O) BÜNYAMİN GEZER (Y) BAKİ TUNCAY AKKIN (Y) ASIM YUSUF ÖZ (D) ZAFER DEMİR
11.02.2010 16:30	DENİZLİ ATATÜRK	DENİZLİSPOR	0-1	MANİSASPOR	(O) BARIŞ ŞİMŞEK (Y) İSMAİL KÖSE (Y) HAKAN ATİLLA GÖKBİLGİN (D) ABDULLAH KALAFATOĞLU
11.02.2010 20:30	BURSA ATATÜRK	BURSASPOR	3-1	FENERBAHÇE	(O) CÜNEYT ÇAKIR (Y) BAHATTİN DURAN (Y) ALPASLAN DEDEŞ (D) METE KALKAVAN